Das SOS-Kinderdorf liegt in der Kleinstadt San Ignacio, etwa 225 Kilometer von der Hauptstadt Asunción entfernt, und wurde auf einem 4,5 Hektar großen Grundstück im Zentrum der Stadt errichtet. Es umfasst 10 Familienhäuser, in denen bis zu 90 Kinder ein liebevolles Zuhause finden können, das Haus des Dorfleiters und ein Verwaltungsgebäude.
Ebenfalls auf dem Grundstück befindet sich ein SOS-Kindergarten mit vier Gruppenräumen, einem Verwaltungsbereich, einer Küche und einem Speisesaal. Bis zu 100 Kinder aus dem SOS-Kinderdorf und aus der Nachbarschaft können hier betreut werden. Für die Jugendlichen des SOS-Kinderdorfes wurden 1998 im Stadtgebiet zwei SOS-Jugendeinrichtungen geschaffen. Dabei handelt es sich um Wohngemeinschaften für in Ausbildung stehende Jugendliche, in denen sie bereits im Verlauf ihrer höheren Schul- und Berufsausbildung Schritt für Schritt auf ein Leben in Selbstständigkeit vorbereitet werden.
Das SOS-medizinische Zentrum San Ignacio, das als Mutter-Kind-Klinik geführt wird, hat eine Kapazität von 25.000 Patientinnen pro Jahr. Es besteht aus fünf Sprech- und Behandlungszimmern und verfügt über 38 Krankenbetten und 24 Säuglingsbetten. Ein Labor, eine Apotheke, ein Kreißsaal, ein Operationssaal für kleine Eingriffe, ein Raum für Röntgen- und Ultraschalluntersuchungen sowie eine Frühgeburtenstation mit drei Brutkästen und zwei Wärmebettchen ergänzen die Infrastruktur.