Der Hauptgrund für die Errichtung des zweiten costaricanischen SOS-Kinderdorfes in Limón war die hohe Anzahl verlassener und verwaister Kinder in dieser Region im Osten. Das SOS-Kinderdorf wurde auf einem Grundstück von 2,1 Hektar erbaut, das etwa drei Kilometer westlich von Limón an einem Ort mit dem Namen "Los Cocos" liegt. Infrastrukturmäßig ist es gut eingebettet, denn ganz in der Nähe gibt es Einkaufsmöglichkeiten, Schulen und ärztliche Versorgung. Das SOS-Kinderdorf Limón wurde im März 2001 im Beisein von SOS-Kinderdorf-Präsident Helmut Kutin offiziell eröffnet, nachdem bereits ein Jahr zuvor die ersten SOS-Familien ihr neues Heim bezogen hatten.
Das SOS-Kinderdorf Limón besteht aus 13 Familienhäusern, dem Dorfleiterhaus, einem Verwaltungsgebäude, einem Mehrzweckraum und Personalwohnungen. In der Nähe des SOS-Kinderdorfes wurden ein Fußball- und ein Basketballplatz errichtet. Außerdem haben die Kinder viele Grünflächen zum Spielen und Austoben.
2005 wurde der frühere SOS-Kindergarten durch ein SOS-Sozialzentrum ersetzt, das sowohl SOS-Kindern als auch Familien aus der Nachbarschaft zugute kommt. Dieses SOS-Sozialzentrum betreibt eine Kindertagesstätte, wo bis zu 80 Babys und Kinder betreut werden können. Es besteht aus drei Gruppenräumen, einem Speisesaal und einem Spielplatz. Weiters bietet das SOS-Sozialzentrum Kurse und Beratung für Eltern der betreuten Kinder an. Diese Maßnahmen dienen der Familienstärkung in der Region, durch die die Anzahl verlassener Kinder verringert werden soll.